Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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