Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms