Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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