Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms