Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ubl4bQ9CQ84 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms