Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Commd4Q9CQ02 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms