Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg3Q9CPX6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms