Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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