Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930550L24RikQ99PA7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms