Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl1Q99N96 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl1Q99N96 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms