Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brms1Q99N20 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms