Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a6dQ99N07 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a6dQ99N07 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a6dQ99N07 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ms4a6dQ99N07 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ms4a6dQ99N07 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ms4a6dQ99N07 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ms4a6dQ99N07 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ms4a6dQ99N07 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a6dQ99N07 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ms4a6dQ99N07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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