Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf17Q99MV7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms