Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms