Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpd3Q99LY2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdpd3Q99LY2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms