Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms