Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Chst12Q99LL3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst12Q99LL3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms