Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms