Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep3Q99KK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms