Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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