Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smim11aQ99J19 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim11aQ99J19 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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