Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms