Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms