Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms