Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt5Q922U2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt5Q922U2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms