Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms