Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Odf3Q920N1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Odf3Q920N1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Odf3Q920N1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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