Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med28Q920D3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms