Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Afg3l1Q920A7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms