Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarca5Q91ZW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms