Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpe65Q91ZQ5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpe65Q91ZQ5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms