Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf6Q91YR7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf6Q91YR7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms