Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acsl6Q91WC3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acsl6Q91WC3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms