Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vps11Q91W86 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vps11Q91W86 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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