Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms