Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cabp4Q8VHC5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cabp4Q8VHC5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms