Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmcd1Q8VEE1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms