Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul7Q8VE73 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul7Q8VE73 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms