Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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