Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BbxQ8VBW5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms