Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmx1Q8VBT0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms