Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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