Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup58Q8R332 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup58Q8R332 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms