Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim29Q8R2Q0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms