Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms