Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CipcQ8R0W1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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