Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms