Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Treml1Q8K558 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms