Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TmieQ8K467 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms