Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms